Jedną z cech wyróżniającą to wydanie Nowego Testamentu spośród innych jest oznaczenie kolorem czerwonym wypowiedzi Jezusa, a kolorem niebieskim tekstów słabo udokumentowanych lub niewystępujących w głównych manuskryptach.

Nowy Testament NPD został wyposażony w aparat studyjny wspierający każdego czytelnika niemającego opieki eklezjalnej w samodzielnym poznawaniu przesłania Bożego Słowa. Zaliczyć do tego należy:

6270 filologicznych, historycznych i teologicznych przypisów dolnych,
15 680 sigli do skrutacji biblijnej (jako marginalia),
27 obszernych wprowadzeń do każdej księgi Nowego Testamentu,
8 kolorowych map,
280 rozbudowanych filologicznych, historycznych i teologicznych komentarzy bazujących na zasadach niekonfesyjnej hermeneutyki biblijnej,
1641 szczegółowych informacji zebranych w tabelach, zestawieniach i grafikach. Zawierają one m.in.:

rozbudowaną tablicę chronologii życia i działalności Jezusa Chrystusa,
rozbudowaną tablicę przedstawiającą 350 proroctw mesjańskich z ST i ich wypełnienie w Jezusie Chrystusie,
zestawienie 150 Bożych imion deskrypcyjnych w odniesieniu do Chrystusa,
wykaz i omówienie 20 podstawowych zasad hermeneutyki biblijnej,
rozbudowaną tablicę przedstawiającą wykaz wszystkich przypowieści i przenośni użytych przez Jezusa,
omówienia wybranych atrybutów Boga,
zestawienie nauczań zawartych w Nowym Testamencie na temat odwiecznego Królestwa Niebios oraz Piekła i wiecznego potępienia

oraz wiele, wiele innych zestawień i komentarzy odnoszących się do ważnych a także często dyskutowanych kwestii teologicznych.