W przeszłości ludzie porzucili wyniszczoną Ziemię i przenieśli się do Nieba. Jednakże ludzkość, która dostąpiła boskości, rozpętała przerażającą wojnę. Niebo, Piekło, nawet samo Przeznaczenie - wszystko poza podstawową rzeczywistością uległo zniszczeniu.

Wtedy ci, którzy utracili posiadaną kiedyś boską moc, wrócili na Ziemię.
Niestety środowisko opuszczonej dawno temu Ziemie zmieniło się nie do poznania poprzez działania bogów natury, którzy tu pozostali. Potwory, mutanty - natura nie wybaczyła ludzkości jej błędów. Ludzie zmuszeni byli do zamieszkania Boskich Terenach, gdzie rezydowały bóstwa Ziemi. Marzyli o odzyskaniu mocy i powrocie do Nieba. Niestety nie było to możliwe, w wyniku czego z uwagi na ograniczone zasoby, wybuchła kolejna wojna.

By rozwiązać problem przestrzeni, ludzie skopiowali Boskie Tereny do innego wymiaru nazwanego Harmonicznym Światem, a następnie przenieśli się tam. Jednakże ludzkość cały czas nie była w stanie odzyskać posiadanej kiedyś boskiej mocy. Postanowili więc odtworzyć warunki i historię, dzięki którym ich przodkom udało się osiągnąć boskość za pierwszym razem. Tak powstał Testament będący swoistym scenariuszem dla ludzkości. Dzięki specyficznej konstrukcji Testamentu opisywana przez niego historia nie była widoczna w całości, a jedynie na sto lat wprzód.

Niestety, w wyniku kolejnej tragedii - zniknięcia Boskich Instrumentów kontrolujących Harmoniczny Świat, ten zawalił się, upadł na Prawdziwy Świat i stopił z nim w wielu miejscach. W roku 1413 Ery Testamentu narody Harmonicznego Świata zaatakowały i podbiły obwinianą o wszystko Japonię, dzieląc terytorium na feudalne lenna i zmuszając pierwotnych mieszkańców Japonii do jej opuszczenia.

Teraz, w roku 1648 Ery Testamentu, uchodźcy z Japonii żyją w gigantycznym statku-mieście Musashi, stale obserwowani przez Unię Testamentu, która nadzoruje działania mające zrekonstruować historię. A większość państw podporządkowała sobie poszczególne treny Japonii i ich mieszkańców.

Jednak w obliczu niepokojącego i niespodziewanego "końca" Testamentu, tajemniczych fenomenów i zniknięć apokalipsa wydaje się coraz bliższa.

Co to wszystko ma wspólnego z totalnie nieodpowiedzialnym przewodniczącym rady studenckiej Akademii Ariadust rządzącej Musashi - Tori Aoi, jego zmarłej dziesięć lat przyjaciółki - Horizon Ariadust oraz androidem P-01s?

Zaczyna się walka z całym światem o jego ocalenie.